E como em toda temporada, a Segundona 2008 terá alguns clubes inusitados e outros velhos conhecidos. Mauaense e Primavera, que foram rebaixados em 2007, garantiram presença. Araçatuba e ECO Osasco faliram e não vão disputar. O ECO cedeu a licença a outro clube da cidade. Trata-se do novato Grêmio Esportivo Osasco.
Na primeira fase as equipes duelam dentro dos próprios grupos em turno e returno, classificando assim as quatro melhores equipes de cada grupo. Na fase seguinte, os 24 times classificados formam quatro grupos de seis times cada e os dois melhores de cada grupo se classificam. As oito melhores equipes foram dois grupos, com quatro times. Os dois melhores de cada grupo conquistam o acesso e disputam a final.
Segundo o regulamento da FPF ‘As associações poderão utilizar atletas nascidos a partir de 1985 e mais 03 (três) nascidos em 1984, ou antes, por partida’.
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